中国晶体学会是中国晶体学工作者自愿组成的，学术性、公益性社会团体，是中国科学技术协会的组成部分。
中国晶体学会前身为国际晶体学联合会中国委员会，1978年以该名义加入国际晶体学联合会(International Union of Crystallography，IUCr)。 1984年唐有祺当选为该会第十三届执行委员会委员，1987年又当选为该会第十四届副主席。1996～1999年张泽当选亚洲晶体学协会( The Asian Crystallographic Association，AsCA )主席。1999～2005年中国科协书记张泽任IUCr执行委员会委员。 学会于1986年在北京组织了首届小分子结构国际学术会议，1988年在天津组织了晶体学暑期国际训练班，1993年在北京成功举办了国际晶体学联合会第十六届学术大会与会员代表大会，加强了国际晶体学界对我国晶体学领域的了解，扩大了国际影响。 1993年3月30日经国家科委批准成立中国晶体学会，4月9日经中国科学技术协会致民政部准予登记，8月19日经民政部批准登记、注册，成立了中国晶体学会筹备委员会，1994年5月31日召开了第一次会员代表大会，从此宣告学会正式成立，挂靠在北京大学。
学会的领导机构为理事会。 理事会每4年改选1次，由全国会员代表选举产生。 现任为第五届理事会，由84名理事组成。目前在册会员1400多人，另有团体会员单位36个。 常务理事会下设生物大分子、小分子、粉末衍射、晶体生长与材料表征、电子晶体学、药物晶体学6个专业委员会和晶体学教育与普及工作委员会。 中国晶体学会积极参与了两院院士候选人的推荐工作。
